MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_35

Total Repeats: 439

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009787	GTC	2	6	4733	4738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149405
2	NC_009787	TGAT	2	8	4767	4774	25 %	50 %	25 %	0 %	157149405
3	NC_009787	CCA	2	6	4849	4854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149405
4	NC_009787	GGA	2	6	4878	4883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149405
5	NC_009787	TCC	2	6	4922	4927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149405
6	NC_009787	GGTGGA	2	12	4928	4939	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	157149405
7	NC_009787	CAG	2	6	4957	4962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
8	NC_009787	TCTG	2	8	5004	5011	0 %	50 %	25 %	25 %	157149405
9	NC_009787	AGG	2	6	5027	5032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149405
10	NC_009787	CAG	2	6	5053	5058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
11	NC_009787	CAG	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
12	NC_009787	AGG	2	6	5075	5080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149405
13	NC_009787	ACG	2	6	5122	5127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
14	NC_009787	CT	3	6	5157	5162	0 %	50 %	0 %	50 %	157149405
15	NC_009787	CAA	2	6	5225	5230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149405
16	NC_009787	CAC	2	6	5279	5284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149405
17	NC_009787	TTC	3	9	5366	5374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149405
18	NC_009787	T	7	7	5435	5441	0 %	100 %	0 %	0 %	157149405
19	NC_009787	TCC	2	6	5463	5468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149405
20	NC_009787	GAA	3	9	5501	5509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149405
21	NC_009787	CAG	2	6	5519	5524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
22	NC_009787	GCC	3	9	5535	5543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149405
23	NC_009787	TTC	2	6	5561	5566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149405
24	NC_009787	GCC	2	6	5603	5608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149405
25	NC_009787	AAT	2	6	5627	5632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149405
26	NC_009787	AAG	2	6	5659	5664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149405
27	NC_009787	A	7	7	5677	5683	100 %	0 %	0 %	0 %	157149405
28	NC_009787	CAG	2	6	5717	5722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
29	NC_009787	TGG	2	6	5725	5730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149405
30	NC_009787	TCG	2	6	5784	5789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149405
31	NC_009787	TAA	2	6	5794	5799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149405
32	NC_009787	AGCC	2	8	5802	5809	25 %	0 %	25 %	50 %	157149405
33	NC_009787	TAGT	2	8	5910	5917	25 %	50 %	25 %	0 %	157149405
34	NC_009787	TCT	2	6	5944	5949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149405
35	NC_009787	CAG	2	6	6023	6028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
36	NC_009787	CTGCC	2	10	6108	6117	0 %	20 %	20 %	60 %	157149405
37	NC_009787	CAC	2	6	6130	6135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149405
38	NC_009787	C	6	6	6310	6315	0 %	0 %	0 %	100 %	157149405
39	NC_009787	T	6	6	6455	6460	0 %	100 %	0 %	0 %	157149405
40	NC_009787	CAT	2	6	6461	6466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149405
41	NC_009787	GAT	2	6	6509	6514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149405
42	NC_009787	CTG	2	6	6527	6532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149405
43	NC_009787	AGC	2	6	6588	6593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
44	NC_009787	GCG	2	6	6594	6599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149405
45	NC_009787	AAT	2	6	6608	6613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149405
46	NC_009787	ATC	2	6	6653	6658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149405
47	NC_009787	TAA	2	6	6699	6704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149405
48	NC_009787	T	6	6	6733	6738	0 %	100 %	0 %	0 %	157149405
49	NC_009787	ATC	2	6	6753	6758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149405
50	NC_009787	ATA	2	6	6774	6779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149405
51	NC_009787	CAG	2	6	6812	6817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149405
52	NC_009787	TAA	2	6	6855	6860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149405
53	NC_009787	ATT	2	6	6869	6874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149405
54	NC_009787	ATA	2	6	6948	6953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149405
55	NC_009787	CTT	2	6	7146	7151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149414
56	NC_009787	TTA	2	6	7169	7174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149414
57	NC_009787	T	6	6	7299	7304	0 %	100 %	0 %	0 %	157149414
58	NC_009787	GCA	2	6	7382	7387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149414
59	NC_009787	CGC	2	6	7450	7455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149414
60	NC_009787	TGTTT	2	10	7818	7827	0 %	80 %	20 %	0 %	157149414
61	NC_009787	ATC	2	6	8602	8607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149422
62	NC_009787	CTT	2	6	8681	8686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149422
63	NC_009787	T	6	6	8685	8690	0 %	100 %	0 %	0 %	157149422
64	NC_009787	TTA	2	6	8707	8712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149422
65	NC_009787	TTC	2	6	8745	8750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149422
66	NC_009787	T	7	7	8782	8788	0 %	100 %	0 %	0 %	157149422
67	NC_009787	CAT	2	6	8789	8794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149422
68	NC_009787	GAC	2	6	8813	8818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149422
69	NC_009787	CAC	2	6	8834	8839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149422
70	NC_009787	TGT	2	6	8851	8856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149422
71	NC_009787	CGC	2	6	8861	8866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149422
72	NC_009787	CATTTG	2	12	8886	8897	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157149422
73	NC_009787	CCA	2	6	8929	8934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149422
74	NC_009787	GAG	2	6	8935	8940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149422
75	NC_009787	AC	3	6	8945	8950	50 %	0 %	0 %	50 %	157149422
76	NC_009787	AAC	2	6	8998	9003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149422
77	NC_009787	AGC	2	6	9085	9090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149422
78	NC_009787	GCTG	2	8	9110	9117	0 %	25 %	50 %	25 %	157149422
79	NC_009787	AGT	2	6	9143	9148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149422
80	NC_009787	TGT	2	6	9167	9172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149422
81	NC_009787	CAT	2	6	9221	9226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149422
82	NC_009787	GAC	2	6	9265	9270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149422
83	NC_009787	GCTG	2	8	9272	9279	0 %	25 %	50 %	25 %	157149422
84	NC_009787	CCA	2	6	9338	9343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149422
85	NC_009787	CAG	2	6	9473	9478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149422
86	NC_009787	CCA	2	6	9502	9507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149422
87	NC_009787	CCT	2	6	9569	9574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149422
88	NC_009787	TC	3	6	9592	9597	0 %	50 %	0 %	50 %	157149422
89	NC_009787	CTG	2	6	9682	9687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149422
90	NC_009787	GGT	2	6	9711	9716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149422
91	NC_009787	GCT	2	6	9731	9736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149422
92	NC_009787	TGC	3	9	9829	9837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149422
93	NC_009787	GCT	2	6	9840	9845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149422
94	NC_009787	TTG	2	6	10033	10038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149422
95	NC_009787	GAC	2	6	10066	10071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149422
96	NC_009787	CCTG	2	8	10114	10121	0 %	25 %	25 %	50 %	157149422
97	NC_009787	ACC	2	6	10126	10131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149422
98	NC_009787	GCCA	2	8	10180	10187	25 %	0 %	25 %	50 %	157149422
99	NC_009787	CGG	2	6	10190	10195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149422
100	NC_009787	CTG	2	6	10250	10255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149422
101	NC_009787	CATGG	2	10	10287	10296	20 %	20 %	40 %	20 %	157149422
102	NC_009787	TAA	2	6	10358	10363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149422
103	NC_009787	CAC	2	6	10383	10388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149422
104	NC_009787	GT	3	6	10457	10462	0 %	50 %	50 %	0 %	157149422
105	NC_009787	GAT	2	6	10614	10619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149422
106	NC_009787	TGG	2	6	10811	10816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149422
107	NC_009787	TCA	2	6	10913	10918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149422
108	NC_009787	TTG	2	6	10936	10941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149422
109	NC_009787	ATA	2	6	10948	10953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149422
110	NC_009787	CAC	2	6	10959	10964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149422
111	NC_009787	CAGC	2	8	11036	11043	25 %	0 %	25 %	50 %	157149422
112	NC_009787	GGGC	2	8	11089	11096	0 %	0 %	75 %	25 %	157149422
113	NC_009787	GGCG	2	8	11151	11158	0 %	0 %	75 %	25 %	157149422
114	NC_009787	AAT	2	6	11217	11222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149422
115	NC_009787	ATA	2	6	11296	11301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149422
116	NC_009787	CGG	2	6	11345	11350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149422
117	NC_009787	CCG	2	6	11431	11436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149422
118	NC_009787	CTG	2	6	11477	11482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149420
119	NC_009787	GAG	2	6	11519	11524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149420
120	NC_009787	CTG	2	6	11527	11532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149420
121	NC_009787	TGT	2	6	11552	11557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149420
122	NC_009787	GC	3	6	11617	11622	0 %	0 %	50 %	50 %	157149420
123	NC_009787	TTCA	2	8	11644	11651	25 %	50 %	0 %	25 %	157149420
124	NC_009787	ACC	2	6	11693	11698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149420
125	NC_009787	CAGGA	2	10	11804	11813	40 %	0 %	40 %	20 %	157149420
126	NC_009787	TGA	2	6	11832	11837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149420
127	NC_009787	TC	5	10	11844	11853	0 %	50 %	0 %	50 %	157149420
128	NC_009787	GT	3	6	11862	11867	0 %	50 %	50 %	0 %	157149420
129	NC_009787	AGGG	2	8	11954	11961	25 %	0 %	75 %	0 %	157149420
130	NC_009787	GACA	2	8	11963	11970	50 %	0 %	25 %	25 %	157149420
131	NC_009787	CCA	2	6	12008	12013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149420
132	NC_009787	TCA	2	6	12015	12020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149420
133	NC_009787	TGC	2	6	12135	12140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149420
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391	NC_009787	AAC	2	6	30823	30828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149415
392	NC_009787	ATT	2	6	30949	30954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149401
393	NC_009787	GAT	2	6	30975	30980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149401
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395	NC_009787	CAGC	2	8	31107	31114	25 %	0 %	25 %	50 %	157149401
396	NC_009787	AGC	2	6	31201	31206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149401
397	NC_009787	GCT	2	6	31227	31232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149401
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399	NC_009787	CATC	2	8	31317	31324	25 %	25 %	0 %	50 %	157149401
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402	NC_009787	AACC	2	8	31470	31477	50 %	0 %	0 %	50 %	157149401
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421	NC_009787	CCA	2	6	33105	33110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149406
422	NC_009787	CCA	2	6	33123	33128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149406
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.